MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 plasmid

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022225	TG	4	8	40	47	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022225	ACT	2	6	231	236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022225	AAG	2	6	252	257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022225	ATG	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022225	ATT	2	6	411	416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022225	GCCAG	2	10	418	427	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_022225	ATCCT	2	10	447	456	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_022225	TTTC	2	8	509	516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022225	TTG	2	6	528	533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022225	GTT	2	6	566	571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022225	ACG	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022225	CAA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022225	TTG	2	6	1597	1602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022225	TC	5	10	1695	1704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022225	TTC	2	6	1720	1725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022225	TTA	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022225	ATT	2	6	1777	1782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022225	TTA	2	6	2418	2423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022225	T	6	6	2453	2458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022225	CTT	2	6	3273	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022225	T	6	6	3320	3325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022225	TAA	2	6	3444	3449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022225	TTA	2	6	7186	7191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022225	AGTA	2	8	7255	7262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022225	A	6	6	7267	7272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022225	CTT	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022225	ATCAAT	2	12	7380	7391	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022225	TTG	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022225	TCG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022225	AAC	2	6	8440	8445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022225	CAA	2	6	8478	8483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022225	ATT	2	6	8523	8528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022225	TA	3	6	11009	11014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022225	TTC	2	6	11732	11737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022225	GC	3	6	11768	11773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022225	ACA	2	6	11781	11786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022225	AAG	2	6	11853	11858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022225	GTT	2	6	11880	11885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022225	TGCAT	2	10	11926	11935	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022225	GGT	2	6	11994	11999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022225	T	6	6	12051	12056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022225	ACC	2	6	12131	12136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_022225	AAC	2	6	12139	12144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022225	T	7	7	12201	12207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022225	TCA	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022225	CTA	2	6	12228	12233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022225	T	7	7	12251	12257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022225	TTTG	2	8	12270	12277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022225	GT	3	6	12290	12295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022225	A	8	8	12328	12335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022225	GCA	2	6	12364	12369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022225	GTT	2	6	12390	12395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022225	AAT	2	6	12404	12409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022225	A	6	6	12430	12435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022225	TGG	2	6	12455	12460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022225	T	7	7	12467	12473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022225	GTT	2	6	12483	12488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022225	ACT	2	6	12502	12507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022225	T	7	7	12712	12718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022225	AGAA	2	8	12779	12786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022225	T	7	7	12819	12825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022225	AGT	2	6	12867	12872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022225	GCT	2	6	12881	12886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022225	TTCA	2	8	12902	12909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022225	GCT	2	6	12936	12941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022225	TAAA	2	8	12971	12978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022225	TTA	2	6	12979	12984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022225	TTA	2	6	13002	13007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022225	GGT	2	6	13050	13055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022225	AG	3	6	13084	13089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022225	GGT	2	6	13106	13111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022225	AG	3	6	13135	13140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022225	TCC	2	6	13198	13203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022225	AG	3	6	13232	13237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022225	AG	4	8	13288	13295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022225	ATCT	2	8	13441	13448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022225	AACTT	2	10	13450	13459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022225	AAAT	2	8	13473	13480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022225	TAAA	2	8	13527	13534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022225	AAC	2	6	13561	13566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022225	TCC	2	6	13577	13582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022225	GCA	2	6	13606	13611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022225	TCA	2	6	13788	13793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022225	CCG	2	6	14286	14291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_022225	ATT	2	6	16201	16206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022225	A	6	6	16235	16240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022225	TTG	2	6	16247	16252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022225	TCG	2	6	16309	16314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022225	AACT	2	8	16345	16352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_022225	GAC	2	6	16393	16398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022225	TCT	2	6	16431	16436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022225	ATTT	2	8	19466	19473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022225	GAT	2	6	20113	20118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022225	CAGC	2	8	20162	20169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022225	AGG	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022225	ATCC	2	8	22030	22037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022225	GTC	2	6	22047	22052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022225	ACA	2	6	22081	22086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022225	TGA	2	6	22124	22129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022225	AAACA	2	10	22149	22158	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022225	TCG	2	6	22181	22186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022225	TAC	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022225	AAC	2	6	22968	22973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022225	CAA	2	6	23006	23011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022225	CA	3	6	23048	23053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022225	CAT	2	6	23060	23065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022225	GCA	2	6	23121	23126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022225	GTTT	2	8	23226	23233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022225	TTG	2	6	23315	23320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022225	CAA	2	6	23449	23454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022225	GCA	2	6	23512	23517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022225	GGA	2	6	23596	23601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022225	AAGT	2	8	23606	23613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022225	GGCT	2	8	23633	23640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022225	TCTTA	2	10	25772	25781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022225	GTT	2	6	25797	25802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022225	ACG	2	6	25825	25830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022225	CAC	2	6	26759	26764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_022225	ACC	2	6	26772	26777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022225	GATCA	2	10	26784	26793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022225	CAA	2	6	26825	26830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022225	TGT	2	6	26841	26846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022225	TAA	2	6	26945	26950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022225	TTA	2	6	26953	26958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022225	CTG	2	6	27002	27007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022225	TAAT	2	8	27014	27021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022225	GTA	2	6	27030	27035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022225	T	6	6	27071	27076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022225	T	6	6	27100	27105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022225	CTA	2	6	27196	27201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022225	A	6	6	30173	30178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022225	AGCC	2	8	30206	30213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022225	CTTCCC	2	12	32465	32476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_022225	C	6	6	32474	32479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_022225	ACAA	2	8	36435	36442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022225	TCA	2	6	37864	37869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022225	GATT	2	8	37888	37895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022225	CTT	2	6	37912	37917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022225	TTG	2	6	40480	40485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022225	ATT	2	6	40507	40512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022225	TTA	3	9	40544	40552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022225	TTG	2	6	40605	40610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022225	TCG	2	6	40667	40672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022225	AAC	2	6	41607	41612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022225	CAA	2	6	41645	41650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022225	AAG	2	6	41707	41712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022225	A	6	6	41714	41719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022225	A	6	6	42756	42761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022225	ACC	2	6	42770	42775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_022225	TCA	2	6	42790	42795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022225	AGG	2	6	42830	42835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022225	TTA	2	6	42866	42871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022225	A	7	7	42881	42887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022225	GA	3	6	44187	44192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022225	ACTC	2	8	44212	44219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_022225	ACT	3	9	47560	47568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_022225	CAT	2	6	47619	47624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_022225	GC	3	6	47652	47657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022225	GAA	2	6	47688	47693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022225	TA	3	6	48411	48416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022225	A	7	7	50052	50058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022225	TAA	2	6	52048	52053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022225	TAT	2	6	52062	52067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022225	GTC	2	6	52079	52084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_022225	ACTC	2	8	52089	52096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_022225	TGA	2	6	52184	52189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022225	TA	3	6	52236	52241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022225	TTTA	2	8	52249	52256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022225	GATCAT	2	12	52279	52290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_022225	CAT	2	6	52349	52354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_022225	ATA	2	6	52485	52490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022225	AG	3	6	52542	52547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022225	T	7	7	52684	52690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022225	TAC	2	6	52739	52744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_022225	GTGG	2	8	52783	52790	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022225	CAG	2	6	52905	52910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_022225	T	6	6	52919	52924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022225	AGGAT	2	10	54231	54240	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022225	AAT	2	6	54252	54257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_022225	GAA	2	6	54317	54322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022225	CTC	2	6	54384	54389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_022225	AT	3	6	55467	55472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022225	TCG	2	6	55536	55541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_022225	CCT	2	6	55544	55549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_022225	GGTA	2	8	59118	59125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022225	TTA	2	6	59132	59137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022225	CCG	2	6	59153	59158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_022225	TCT	2	6	60756	60761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_022225	GCAA	2	8	61552	61559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_022225	CAG	2	6	61762	61767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_022225	T	6	6	61776	61781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022225	AGGAT	2	10	63088	63097	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022225	AAT	2	6	63109	63114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022225	CTGA	2	8	63218	63225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_022225	CCGT	2	8	63253	63260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
196	NC_022225	CTT	2	6	63295	63300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_022225	AGA	2	6	63336	63341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_022225	ACA	2	6	63391	63396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_022225	TA	3	6	64258	64263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_022225	AGTA	2	8	64523	64530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
201	NC_022225	GAT	2	6	64834	64839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
202	NC_022225	GAA	2	6	64840	64845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
203	NC_022225	TGC	2	6	64888	64893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
204	NC_022225	CCG	2	6	64922	64927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
205	NC_022225	CTT	2	6	65490	65495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
206	NC_022225	CCG	2	6	66014	66019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
207	NC_022225	AAC	2	6	66075	66080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
208	NC_022225	GCT	2	6	66087	66092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.